MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005835	TCA	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198309
2	NC_005835	TCC	2	6	80	85	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
3	NC_005835	C	6	6	84	89	0 %	0 %	0 %	100 %	46198309
4	NC_005835	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
5	NC_005835	CAC	2	6	119	124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198309
6	NC_005835	CCCTG	2	10	223	232	0 %	20 %	20 %	60 %	46198309
7	NC_005835	GC	3	6	236	241	0 %	0 %	50 %	50 %	46198309
8	NC_005835	ACC	2	6	286	291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198309
9	NC_005835	CTT	2	6	364	369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198309
10	NC_005835	GGC	2	6	393	398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198309
11	NC_005835	C	6	6	444	449	0 %	0 %	0 %	100 %	46198309
12	NC_005835	AGG	2	6	459	464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
13	NC_005835	CCT	2	6	475	480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
14	NC_005835	CCT	2	6	505	510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
15	NC_005835	CCT	2	6	541	546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
16	NC_005835	C	6	6	563	568	0 %	0 %	0 %	100 %	46198309
17	NC_005835	AGG	2	6	669	674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
18	NC_005835	G	6	6	679	684	0 %	0 %	100 %	0 %	46198309
19	NC_005835	GGA	2	6	721	726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
20	NC_005835	CTC	3	9	728	736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
21	NC_005835	G	6	6	759	764	0 %	0 %	100 %	0 %	46198309
22	NC_005835	CCA	3	9	784	792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198309
23	NC_005835	CCCTT	2	10	796	805	0 %	40 %	0 %	60 %	46198309
24	NC_005835	CCA	2	6	820	825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198309
25	NC_005835	TGCC	2	8	834	841	0 %	25 %	25 %	50 %	46198309
26	NC_005835	TCC	2	6	843	848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198309
27	NC_005835	GTCCA	2	10	855	864	20 %	20 %	20 %	40 %	46198309
28	NC_005835	GAGGGG	2	12	869	880	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198309
29	NC_005835	GAG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
30	NC_005835	GAG	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
31	NC_005835	GGGTG	2	10	949	958	0 %	20 %	80 %	0 %	46198309
32	NC_005835	GGA	2	6	961	966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
33	NC_005835	G	6	6	1009	1014	0 %	0 %	100 %	0 %	46198309
34	NC_005835	GCG	2	6	1053	1058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198309
35	NC_005835	AGG	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198309
36	NC_005835	GAGG	2	8	1106	1113	25 %	0 %	75 %	0 %	46198309
37	NC_005835	G	6	6	1153	1158	0 %	0 %	100 %	0 %	46198309
38	NC_005835	TGG	2	6	1159	1164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198309
39	NC_005835	TGG	2	6	1375	1380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198310
40	NC_005835	AGG	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198310
41	NC_005835	G	7	7	1428	1434	0 %	0 %	100 %	0 %	46198310
42	NC_005835	GGA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198310
43	NC_005835	GCC	2	6	1491	1496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198310
44	NC_005835	CAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198310
45	NC_005835	CGC	2	6	1532	1537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198310
46	NC_005835	CGC	2	6	1541	1546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198310
47	NC_005835	CG	3	6	1637	1642	0 %	0 %	50 %	50 %	46198310
48	NC_005835	CGC	2	6	1718	1723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198310
49	NC_005835	G	7	7	1739	1745	0 %	0 %	100 %	0 %	46198310
50	NC_005835	C	6	6	1783	1788	0 %	0 %	0 %	100 %	46198310
51	NC_005835	GA	3	6	1872	1877	50 %	0 %	50 %	0 %	46198310
52	NC_005835	GGA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198310
53	NC_005835	GAG	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198310
54	NC_005835	TCA	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198310
55	NC_005835	G	6	6	2007	2012	0 %	0 %	100 %	0 %	46198310
56	NC_005835	ATG	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198310
57	NC_005835	GGC	2	6	2038	2043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198310
58	NC_005835	TGA	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198311
59	NC_005835	CGG	2	6	2216	2221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198311
60	NC_005835	TCG	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198311
61	NC_005835	CGG	2	6	2278	2283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198311
62	NC_005835	GAG	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198311
63	NC_005835	CGC	2	6	2381	2386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198311
64	NC_005835	CAC	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198311
65	NC_005835	CGG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198311
66	NC_005835	GGC	2	6	2456	2461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198311
67	NC_005835	GGA	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198311
68	NC_005835	TTC	2	6	2469	2474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198311
69	NC_005835	AGG	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198311
70	NC_005835	CCAGGA	2	12	2549	2560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198311
71	NC_005835	GCC	2	6	2610	2615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198311
72	NC_005835	CAC	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198311
73	NC_005835	GAC	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198312
74	NC_005835	G	7	7	2740	2746	0 %	0 %	100 %	0 %	46198312
75	NC_005835	TCT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198312
76	NC_005835	CTACCG	2	12	2794	2805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46198312
77	NC_005835	GGC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198312
78	NC_005835	GGA	2	6	2824	2829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
79	NC_005835	CCT	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198312
80	NC_005835	TAC	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198312
81	NC_005835	CTT	2	6	2881	2886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198312
82	NC_005835	GCGG	2	8	2904	2911	0 %	0 %	75 %	25 %	46198312
83	NC_005835	C	7	7	2914	2920	0 %	0 %	0 %	100 %	46198312
84	NC_005835	AGG	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
85	NC_005835	GCC	2	6	2933	2938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198312
86	NC_005835	CTTCGG	2	12	2947	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198312
87	NC_005835	GGA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
88	NC_005835	G	8	8	3042	3049	0 %	0 %	100 %	0 %	46198312
89	NC_005835	TCC	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198312
90	NC_005835	TGGGCC	2	12	3084	3095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198312
91	NC_005835	TCC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198312
92	NC_005835	C	7	7	3133	3139	0 %	0 %	0 %	100 %	46198312
93	NC_005835	TGG	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198312
94	NC_005835	CG	3	6	3172	3177	0 %	0 %	50 %	50 %	46198312
95	NC_005835	TCT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198312
96	NC_005835	TGGAGG	2	12	3216	3227	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46198312
97	NC_005835	AGG	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
98	NC_005835	C	6	6	3274	3279	0 %	0 %	0 %	100 %	46198312
99	NC_005835	CGGG	2	8	3301	3308	0 %	0 %	75 %	25 %	46198312
100	NC_005835	GCGGAG	2	12	3374	3385	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198312
101	NC_005835	GAG	2	6	3440	3445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
102	NC_005835	GCG	2	6	3446	3451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198312
103	NC_005835	C	6	6	3472	3477	0 %	0 %	0 %	100 %	46198312
104	NC_005835	CCT	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198312
105	NC_005835	GTC	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198312
106	NC_005835	GGA	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
107	NC_005835	CTT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198312
108	NC_005835	CGC	2	6	3604	3609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198312
109	NC_005835	GGA	2	6	3628	3633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
110	NC_005835	GCCGGG	2	12	3676	3687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198312
111	NC_005835	TCC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198312
112	NC_005835	C	6	6	3771	3776	0 %	0 %	0 %	100 %	46198312
113	NC_005835	C	6	6	3806	3811	0 %	0 %	0 %	100 %	46198312
114	NC_005835	CCT	3	9	3835	3843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198312
115	NC_005835	GGT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198312
116	NC_005835	GAG	2	6	3887	3892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198312
117	NC_005835	GAG	3	9	4000	4008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198313
118	NC_005835	TCC	2	6	4019	4024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198313
119	NC_005835	CCT	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198313
120	NC_005835	GGA	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198313
121	NC_005835	CCG	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198313
122	NC_005835	GTG	3	9	4111	4119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198313
123	NC_005835	AGC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198313
124	NC_005835	CCGC	2	8	4139	4146	0 %	0 %	25 %	75 %	46198313
125	NC_005835	GAG	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198313
126	NC_005835	TCC	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198313
127	NC_005835	GGACG	2	10	4219	4228	20 %	0 %	60 %	20 %	46198313
128	NC_005835	G	6	6	4369	4374	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
129	NC_005835	GTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198314
130	NC_005835	CTC	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198314
131	NC_005835	GGT	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198314
132	NC_005835	GC	3	6	4524	4529	0 %	0 %	50 %	50 %	46198314
133	NC_005835	GGA	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198314
134	NC_005835	CTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198314
135	NC_005835	G	7	7	4610	4616	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
136	NC_005835	CCT	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198314
137	NC_005835	CCT	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198314
138	NC_005835	CTC	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198314
139	NC_005835	TTC	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198314
140	NC_005835	CCG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198314
141	NC_005835	AGG	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198314
142	NC_005835	G	6	6	4714	4719	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
143	NC_005835	AGG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198314
144	NC_005835	G	6	6	4770	4775	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
145	NC_005835	TCA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198314
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152	NC_005835	G	6	6	5053	5058	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
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154	NC_005835	CCG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198314
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156	NC_005835	TGG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198314
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158	NC_005835	CCG	2	6	5230	5235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198314
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162	NC_005835	GGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198314
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164	NC_005835	TCC	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198314
165	NC_005835	GGT	2	6	5360	5365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198314
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171	NC_005835	GCCTTC	2	12	5634	5645	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46198314
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174	NC_005835	G	6	6	5690	5695	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
175	NC_005835	G	6	6	5779	5784	0 %	0 %	100 %	0 %	46198314
176	NC_005835	GCG	2	6	5798	5803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198314
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179	NC_005835	CGA	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198314
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261	NC_005835	GGT	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198318
262	NC_005835	G	6	6	9075	9080	0 %	0 %	100 %	0 %	46198318
263	NC_005835	G	7	7	9082	9088	0 %	0 %	100 %	0 %	46198318
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265	NC_005835	CCG	2	6	9127	9132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198318
266	NC_005835	TGG	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198318
267	NC_005835	C	7	7	9176	9182	0 %	0 %	0 %	100 %	46198318
268	NC_005835	CGCC	2	8	9193	9200	0 %	0 %	25 %	75 %	46198318
269	NC_005835	GGC	2	6	9219	9224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198318
270	NC_005835	CGC	2	6	9292	9297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198318
271	NC_005835	CTT	2	6	9313	9318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198318
272	NC_005835	CTT	2	6	9325	9330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198318
273	NC_005835	CGC	2	6	9367	9372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198318
274	NC_005835	GCC	2	6	9377	9382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198318
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279	NC_005835	TCC	2	6	9486	9491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198318
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401	NC_005835	TGG	2	6	14264	14269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198322
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405	NC_005835	G	6	6	14516	14521	0 %	0 %	100 %	0 %	46198323
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408	NC_005835	GCG	2	6	14572	14577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198323
409	NC_005835	G	6	6	14583	14588	0 %	0 %	100 %	0 %	46198323
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